Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx2ipQ8VC66 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms