Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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