Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms