Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms