Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp20Q8C6M1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp20Q8C6M1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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