Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms