Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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