Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms