Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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