Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Clec18aQ7TSQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clec18aQ7TSQ1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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