Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcl2Q78Y63 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms