Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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