Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atg16l2Q6KAU8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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