Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HrQ61645 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HrQ61645 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HrQ61645 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HrQ61645 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms