Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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ApcQ61315 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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ApcQ61315 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApcQ61315 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApcQ61315 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApcQ61315 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms