Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnot7Q60809 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnot7Q60809 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnot7Q60809 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cnot7Q60809 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cnot7Q60809 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cnot7Q60809 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms