Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb6Q60692 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms