Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms