Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Fam208bQ5DTT3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Fam208bQ5DTT3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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