Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms