Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc185Q3V118 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms