Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms