Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx27Q3UHD6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx27Q3UHD6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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