Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms