Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms