Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc174Q3U155 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms