Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms