Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms