Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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