Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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