Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cers3Q1A3B0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cers3Q1A3B0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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