Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q149G0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q149G0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q149G0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q149G0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q149G0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms