Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc1Q0VDN7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms