Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms