Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms