Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBQ06643 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms