Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms