Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms