Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad50P70388 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad50P70388 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms