Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms