Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsnl1P62761 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsnl1P62761 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsnl1P62761 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms