Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp46P62069 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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