Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CckbrP56481 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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