Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cox7bP56393 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cox7bP56393 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cox7bP56393 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cox7bP56393 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms