Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sh3bp1P55194 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sh3bp1P55194 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sh3bp1P55194 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3bp1P55194 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3bp1P55194 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3bp1P55194 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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