Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41l4aP52963 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms