Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Apobec1P51908 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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