Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Klf1P46099 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Klf1P46099 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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