Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CskP41241 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CskP41241 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CskP41241 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CskP41241 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CskP41241 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CskP41241 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CskP41241 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CskP41241 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CskP41241 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CskP41241 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CskP41241 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CskP41241 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CskP41241 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CskP41241 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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