Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms